全国各地で急拡大する変異ウイルスへの感染。感染力が高いタイプや新型コロナワクチンが効きにくくなるタイプなど様々です。その変異ウイルスの選別に必要なのが、ウイルスのゲノム解析。最新の現場を取材しました。
研究施設の一角で素早く正確に動き続けるロボット。一体何をしているのでしょうか。
「このロボットはヒト型汎用ロボットの『まほろ』といいます。新型コロナウイルスのゲノム解析の前処理をやっています」(RBI 夏目 徹 取締役)
このシステムは研究者が行う様々な準備や複雑な作業を、人間に代わってロボットが進めてくれます。試薬のかくはんや冷蔵庫の開閉など、デリケートな動きも器用にこなします。
「このロボットはコロナウイルスのゲノム解析のために作られたロボットではなく、iPS細胞の培養やがんゲノム診断、創薬の研究などに使われているロボット。ウイルスがなくなったら元の仕事に戻るか、別の仕事をすれば良いので」(RBI 夏目 徹 取締役)
24時間、黙々と作業が続けられるため、2台のロボットで1日に6000件の変異ウイルスの解析が可能です。しかし、現状は1日に数百件の解析にとどまっているといいます。
「このロボットも全国に21台あります。検体をどういうふうに運搬して受け入れるかというロジスティックがきちんと整備されていないので、それはまだ、これからだと思います」(RBI 夏目 徹 取締役)
現在国内で確認され、拡大が懸念されている変異ウイルスは、主に2つのタイプ。イギリスなどで広がり、感染力が強いとされる「N501Y」と、免疫やワクチンの効果が低下する可能性が指摘されている「E484K」です。
「これまで以上に感染(力)が強い。濃厚接触者の中でも感染が、その分たくさん出ているわけであります」(西村康稔 経済再生相)
「現在私たちは感染力が極めて強い変異ウイルス『N501Y』の脅威に直面しております」(東京都 小池百合子 知事)
特に感染力が強い「N501Y」の変異を持つイギリス型のウイルスについては、国立感染症研究所が国内の事例から感染者1人が平均何人にうつすかを示す実効再生産数を調査。すると従来型のウイルスに比べ、平均で1.32倍高くなっていることが分かりました。
感染した変異ウイルスのタイプによって患者の病室を分けている東京・品川区の昭和大学病院。変異ウイルスへの対応は従来型より負担が大きいと病院長は指摘します。
「入院してくるときにはPCR陽性で、どの変異ウイルスなのかわからない。最終的にわかるまでは個室対応になってしまう。患者の対応も、それぞれ別になるから、当然ながら(病院側の)負担は大きくなる」(昭和大学病院 相良博典 病院長)
少しでも早く変異ウイルスのタイプを判別できれば、医療従事者の負担軽減につながります。
こちらの企業では、複数の変異ウイルスを同時に検出できる検査を今月からスタートさせました。
「一番上の青い線が『E484K』を検出できるカーブになります。下の茶色いものが『イギリス株』の変異を検出できるものになります」
PCR検査で陽性となった検体が、変異ウイルスかどうか判明するまでに要する時間は2時間程度だといいます。
「民間でも非常にはやい時間でできるので、変異ウイルスの検査の比率を10~40%と言わず、100%に近づけることが重要」(リプロセル 横山周史 社長)
これは厚生労働省がまとめた都道府県別の変異ウイルスの確認数です。大阪と兵庫が突出しています。その大阪では9日、新たに883人の感染を確認。8日の905人に次ぐ過去2番目の多さです。
「N501Y型の英国型の変異ウイルスについては感染速度だけでなく、重症化率も高い。これはほぼ明らか、重症化する速度も速い状況です」(大阪府 吉村洋文 知事)
府によると、変異ウイルスの感染者は発症から重症化するまでの日数が短いことや、重症化する50代以下の割合が高いことが分かっています。
こうした中、沖縄県では県内の感染者からアメリカ由来の変異ウイルスが確認されたことが分かりました。空港検疫以外での確認は国内で初めてです。この変異ウイルスは主にアメリカのカリフォルニア州などで確認されている『L452R』で、先月下旬、国立感染症研究所で判明したということです。(09日23:46)
#変異ウイルス #ゲノム解析 #ロボット
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各地で変異ウイルスの猛威・最新ゲノム解析の現場は
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